PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA AKTIF SIRIH (Piper betle L) TERHADAP RESEPTOR HSV-1 SEBAGAI KANDIDAT ANTI HERPES

Yunita Al Azzahra; Taufik Septiyan Hidayat; Syumillah Saepudin

doi:10.61329/pscp.v2i1.22

Authors

Yunita Al Azzahra Akademi Farmasi Bumi Siliwangi Bandung
Taufik Septiyan Hidayat Universitas Al Ghifari, Jl. Cisaranten Kulon No.140, Bandung, 40293, Indonesia
Syumillah Saepudin Universitas Al Ghifari, Jl. Cisaranten Kulon No.140, Bandung, 40293, Indonesia

DOI:

https://doi.org/10.61329/pscp.v2i1.22

Keywords:

Penambatan Molekul, Sirih, HSV-1, Herpes, AutodockTools

Abstract

Tanaman sirih secara tradisional telah digunakan untuk pengobatan beberapa penyakit seperti bau mulut, penyembuhan luka, anti radang, batuk pilek, gangguan pencernaan. Sebagian besar manfaat sirih untuk kesehatan berasal dari senyawa bioaktif fenolik yang terdapat pada tanaman sirih, senyawa polifenol juga diketahui memiliki berpotensi sebagai antivirus. Herpes Simplex Virus (HSV) adalah patogen yang sangat menular yang menyebabkan infeksi berulang. Infeksi herpes disebabkan oleh masuknya virus ke dalam sel hingga mencapai lapisan membran atau gabungan sel. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sifat ADMET dan memprediksi ikatan senyawa bioaktif yang terkandung dalam sirih terhadap reseptor HSV-1 dengan kode protein 2KI5 sebagai kandidat obat antiherpes. Metode yang digunakan pada penelitian ini secara in silico yaitu penambatan molekul menggunakan aplikasi AutodockTools dengan visualiasi menggunakan aplikasi Discovery Studio. Dari hasil penelitian ini diketahui bahwa senyawa bioaktif dari tanaman sirih mempunyai aktivitas pengikatan terhadap reseptor HSV-1, senyawa 4-Allylphenol dengan nilai ΔG -7.79 Kkal/Mol dan Ki 1.96 µM dan 4 kemiripan asam amino dengan senyawa pembanding diprediksi dapat dijadikan sebagai kandidat obat antiherpes karena memiliki sifat absorbsi, distribusi, metabolisme, eksresi dan toksisitas yang baik.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Madhumita M, Guha P, Nag A. Bio-actives of betel leaf (Piper betle L.): A comprehensive review on extraction, isolation, characterization, and biological activity. Phyther Res. 2020;34(10):2609–27.

Mani P, Menakha M, Al-Aboody MS, Alturaiki W, Vijaya Kumar R. Molecular docking of bioactive compounds from Piper plants against secreted aspartyl proteinase of Candida albicans causing oral candidiasis. Int J Pharm Clin Res. 2016;8(10):1380–9.

Saran N. Molecular docking analysis of a secondary metabolite with the glycoprotein receptors of HSV 1 and HSV 2. Bioinformation. 2019;15(12):887–93.

WHO. Virus herpes simpleks. 2023; Available from: https://www.who.int/news-room/factsheets/detail/herpes simplex-virus

Jensen F. Introduction of Computational Chemistry, 2nd edition. Denmark: John Wiley and Sons; 2007.

Castro-Alvarez A, Costa AM VJ. The Performance of Several Docking Programs at Reproducing Protein-Macrolide-Like Crystal Structures. Molecules. 2017;(1):136.

Lu G, Zhang N, Qi J, Li Y, Chen Z, Zheng C, et al. Crystal Structure of Herpes Simplex Virus 2 gD Bound to Nectin-1 Reveals a Conserved Mode of Receptor Recognition. J Virol. 2014;88(23):13678–88.

Pires DEV, Blundell TL, Ascher DB. pkCSM: Predicting small-molecule pharmacokinetic and toxicity properties using graph-based signatures. J Med Chem. 2015;58(9):4066–72.

Hartanti IR, Putri AA, Auliya AS NN, Triadenda AL, Laelasari E, Suhandi C, et al. Molecular Docking Senyawa Xanton, Benzofenon, Dan Triterpenoid Sebagai Antidiabetes Dari Ekstrak Tumbuhan Garcinia Cowa. J Kim. 2022;16(1):72.

Rampogu S, Parameswaran S, Lemuel MR, Lee KW. Exploring the Therapeutic Ability of Fenugreek against Type 2 Diabetes and Breast Cancer Employing Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulations. Evidence-based Complement Altern Med. 2018;2018.

Syahputra G, Ambarsari L, T S. Simulasi docking kurkumin enol, bisdemetoksikurkumin dan analognya sebagai inhibitor enzim12-lipoksigenase. Biofisika. 2014;10(1):55–67.